チケット切ったら、対応してくれました。
結局原因は、ハードウェアノードのディスク容量が不足していたことだそうで・・・。って、ディスクの残り容量くらい監視してないんですか。対処方法は、使わないデータを削除するという原始的方法。せっかく仮想化してるんだから、別のノードにマイグレーションしてくれればいいのに。どうも、VPSLinkは、アカウントをうまくノード間で最適配分できていない気がする。